未经边检机关允许在出入境通道设置关卡

根据违法行为的性质和情节，处理方式可能包括警告、罚款、没收违法所得、责令停止违法行为、限期拆除擅自设置的关卡等。若情节严重，还可能面临行政拘留等更严厉的处罚。同时，边检机关有权依法采取必要的强制措施，恢复正常的出入境秩序。
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直接回复：需依法严肃处理。从法律角度看，处理方式包括对该组织进行罚款、没收违法所得、责令停止违法行为等。若该组织的行为构成犯罪，还可能被追究刑事责任。在选择处理方式时，应综合考虑违法行为的性质、情节、社会危害程度以及组织的经济状况等因素，确保处理结果既合法又合理。
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进一步想问的问题可能是：这种行为是否构成违法？从法律角度看，未经边检机关允许，在出入境通道擅自设置关卡，严重干扰了正常的出入境秩序，违反了《出境入境管理法》等相关法律法规，可能构成违法行为。